Да, документы, подписанные nopaper, имеют юридическую силу и принимаются налоговыми органами, а также иными государственными органами (с учетом исключений, требующих обязательного применения квалифицированной электронной подписи либо оформления документов в бумажном письменном виде). Единственный документ во взаимоотношениях с налоговой, требующий наличия квалифицированной электронной подписи, - электронные счета-фактуры (ст.169 НК РФ). Все прочие документы в отношениях с контрагентами могут быть подписаны неквалифицированной электронной подписью и будут приняты налоговыми органами.
Статья 9 Федерального закона от 06.12.11 № 402-ФЗ «О бухгалтерском учете» устанавливает, что первичный документ может быть составлен как на бумаге, так и в виде электронного документа, подписанного электронной подписью.
Электронные документы, подписанные усиленной неквалифицированной электронной подписью, исходя из положений Федерального закона от 06.04.2011 № 63-ФЗ «Об электронной подписи», признаются для целей бухгалтерского учета и налогообложения равнозначными документу на бумажном носителе, подписанному собственноручной подписью, в случаях, установленных соглашением между участниками документооборота (см. пп. а) п.1. ответов) либо нормативно-правовым актом.
Эту позицию поддерживают сами контролирующие органы. Смотрите письма Минфина России от 07.07.2011 № 03-03-06/1/409, от 14.06.2011 № 03-02-07/1-190, от 9.09.2015 г. № СА-4-7/15871, более свежее - от 27.04.20 № 03-03-06/1/34096.